Une formation est proposée aux enseignants qui souhaitent mettre en place le programme et aux infirmiers scolaires travaillant dans une école où a lieu Croq’Santé. Cette formation a pour objectif de comprendre le principe du programme, ses objectifs, ainsi que le contexte de sa création. Elle permet aussi d’approfondir le contenu de chaque étape et de détailler les séances proposées. Les outils, dont la mallette pédagogique et les affiches permettant la mise en place du programme, sont également donnés ou transmis lors de la formation.
 
Cette formation peut se faire en présentiel, dans nos locaux, ou, selon les circonscriptions, dans une école. La formation est également proposée en ligne, via la connexion à l’espace "Membres", sous réserve d’inscription validée par la Fondation JDB.